公司停发员工工资可能违法，需谨慎处理。依据《劳动法》，公司不得随意克扣员工工资。丢失设备应通过合法途径解决，如协商或法律手段追责。引用《劳动法》相关规定，公司单方面停发工资可能违反法律规定，因为劳动法保护员工合法权益，禁止无故克扣工资。若设备丢失，应通过协商或法律途径解决，而非直接停发工资，否则可能面临法律风险。严重情况下，公司未经法定程序即停发工资，可能构成对员工权益的侵害，导致法律纠纷和赔偿责任。
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员工工资被停发，常见处理方式是协商、申请仲裁或提起诉讼。首先应与公司协商，协商无果的可向劳动仲裁部门申请仲裁；对仲裁不服的再提起诉讼。选择处理方式时，应优先考虑协商解决，这是最快捷的方式。若协商不成，再考虑法律途径，先仲裁后诉讼。
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不同情况下处理方式：1.协商：首先尝试与公司沟通，表达合理诉求，争取理解。2.申请仲裁：若协商无果，向劳动仲裁委员会提出申请，要求公正裁决。3.提起诉讼：对仲裁结果不满，可向人民法院起诉，维护自身权益。